舟曲县审计局成立于1984年1月，正科级建制，是隶属于县人民政府，主管全县审计工作的政府工作部门。下属事业单位一个，即舟曲县“三农”资金审计中心。截至2019年12月，实际在岗人员29人，其中本科以上学历18人，学士学位5人，人员平均年龄38岁。舟曲县审计局核定编制37名（行政编制7名，事业编制30名），其中局长1名、副局长2名，“三农”资金审计中心主任1名。