舟曲县自然资源局是县政府工作部门，为正科级。加挂舟曲县林业和草原局、舟曲县不动产登记管理局、舟曲县绿化委员会办公室牌子。舟曲县自然资源局设下列内设机构：综合办公室，国土空间调查规划用途管制股，自然资源开发利用确权登记股，国土空间资源保护修复股，国家公园管理股。舟曲县自然资源局贯彻落实党中央、省、州、县委关于自然资源工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对自然资源工作的集中统一领导。